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» Facundoquirogafm
Fecha: 10/06/2025 19:48
Biog5 se denomina el trabajo desarrollado desde el Laboratorio de Estructura Molecular y Propiedades (LEMyP, UNNE -CONICET) que, por medio de herramientas bioinformáticas, analiza genomas y proteínas del Virus del Papiloma Humano, con el fin de clasificar cepas, predecir el riesgo de variantes desconocidas y aportar a la vigilancia epidemiológica de esta enfermedad. El Virus del Papiloma Humano (HPV) forma parte de una amplia familia de virus relacionados, capaces de provocar desde lesiones benignas, como verrugas genitales, hasta afecciones más graves como distintos tipos de cáncer. Existen identificadas cerca de 200 cepas de HPV, de las cuales al menos 14 están relacionadas con cáncer, especialmente los tipos 16 y 18, considerados de alto riesgo y asociados principalmente al cáncer de cérvix. Actualmente, sólo los tipos más prevalentes y de alto riesgo del HPV están cubiertos por las vacunas profilácticas disponibles, las cuales están diseñadas para prevenir la infección mediante la inducción de una respuesta inmune contra proteínas estructurales del virus, principalmente la L1. Aunque existen investigaciones en curso y desarrollos prometedores de vacunas terapéuticas que apuntan a proteínas oncogénicas, como E6 y E7 implicadas en la transformación celular y el desarrollo del cáncer, estas aún no han sido aprobadas para su uso clínico. En ese contexto, surgió Biog5, un proyecto que tuvo su origen como trabajo final de la materia Bioinformática Avanzada (UBA), realizado por el Lic. Ernesto Rafael Perez junto a la Dra. Sofía Erdozain. La temática elegida fue el análisis del Virus del Papiloma Humano (HPV), por su importancia sanitaria a nivel nacional e internacional. De allí el nombre Biog5, pues integraban el grupo 5 de Bioinformática. Finalizada esa etapa académica, el desarrollo del sistema fue retomado y ampliado dentro del Laboratorio de Estructura Molecular y Propiedades (LEMyP), del Instituto de Química Básica y Aplicada del Nordeste Argentino (IQUIBA-NEA, CONICET-UNNE), donde se consolidó como una línea de trabajo propia del grupo. Desde entonces, el proyecto es desarrollado por el Lic. Ernesto Rafael Perez, y cuenta con la colaboración del Prof. Leonardo Gómez Chávez, el Prof. Germán Conti, el Dr. Emilio Angelina y la Dra. Nélida Peruchena, todos del LEMyP. Biog5 integra herramientas de biología computacional y bioinformática para analizar proteínas clave del HPV (como E1, E2, E7, L1 y L2) y establecer comparaciones entre cepas de diferentes niveles de riesgo. Esta información permite identificar variantes potencialmente relevantes desde el punto de vista clínico, predecir riesgos y clasificar nuevas cepas, con el objetivo de contribuir a la vigilancia epidemiológica y eventualmente al diseño de tratamientos y vacunas más efectivos. "El proyecto busca aprovechar el potencial de las nuevas herramientas informáticas aplicadas al estudio molecular de los virus. A través de análisis automatizados y comparativos, generamos datos que pueden ser de utilidad para la salud pública", explicó el Lic. Perez, principal referente del sistema. Avances En cuanto a los avances principales del proyecto, sobre una base de datos de más de 100 cepas de HPV de distintas plataformas de secuencias de ADN, se pudo realizar la clasificación genotípica de las mismas según el tipo de riesgo: alto riesgo, bajo riesgo y riesgo no determinadas. Dentro de cada grupo de riesgo se pudieron establecer "clases" de cepas, definidas por atributos como patogenicidad y capacidad de propagación, factores clave en estudios epidemiológicos. Estas categorías permiten analizar comportamientos virales diferenciados dentro de un mismo nivel de riesgo. También se avanzó en la construcción de árboles filogenéticos, generados a partir de alineamientos múltiples por tipo de proteína y grupo de riesgo. Esta herramienta permite visualizar relaciones evolutivas entre cepas y es útil para comparar nuevas secuencias con variantes previamente clasificadas Uno de los últimos avances fue la comparación entre cepas no incluidas en vacunas actuales y aquellas cubiertas por esquemas profilácticos. Se identificaron algunas variantes con alta similitud proteica, lo que sugiere un posible efecto cruzado. "Puede existir una vacuna destinada a una determinada cepa, que sin embargo podría tener efectos sobre otras similares no estudiadas, y de ahí la importancia de este aspecto de nuestro estudio", señaló el Lic. Perez. Aunque aún no se cuenta con evidencia clínica que lo confirme, estos hallazgos refuerzan la importancia de seguir caracterizando variantes y podrían servir como base para el desarrollo de nuevas vacunas profilácticas que contemplen cepas genéticamente relacionadas. Relevancia "Biog5 demostró ser una herramienta bioinformática ágil y eficiente para analizar genomas y proteínas del virus del papiloma humano", destacaron desde el equipo a cargo del proyecto. Indicaron que se proyectan futuras mejoras del modelo desarrollado, con el fin de optimizar la gestión de datos, la parametrización y la usabilidad, además de integrar modelos de machine learning para análisis más precisos. El Lic. Perez destacó que se trata de una línea de estudio iniciada hace dos años y que ya permitió importantes resultados, lo que respalda la continuidad del proyecto, así como la búsqueda de nuevos objetivos.
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