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» Diario Puntal
Fecha: 02/05/2024 13:08
El artículo, traducido por Salud & Ciencia, continua de la siguiente manera. Es probable que el brote haya comenzado cuando el virus saltó de un ave infectada a una vaca, probablemente a finales de diciembre o principios de enero. Esto implica una propagación prolongada y no detectada del virus, lo que sugiere que más ganado en todo Estados Unidos, e incluso en regiones vecinas, podría haber sido infectado con influenza aviar de lo que se informa actualmente. Estas conclusiones se basan en análisis rápidos y resumidos realizados por investigadores, luego de que el Departamento de Agricultura de EE. UU. (USDA) volcara datos genómicos en un repositorio público a principios de esta semana. Pero, para consternación de los científicos, los datos publicados no incluyen información crítica que arrojaría luz sobre los orígenes y la evolución del brote. Los investigadores también expresan su preocupación por que los datos genómicos no se publicaron hasta casi cuatro semanas después de que se anunciara el brote. “La velocidad es especialmente importante para los patógenos respiratorios de rápida propagación que tienen el potencial de provocar pandemias”, dice Tulio de Oliveira, bioinformático de la Universidad Stellenbosch en Sudáfrica. No se espera que el brote en ganado permita que el virus adquiera la capacidad de propagarse entre personas, pero los investigadores dicen que es importante estar atentos. “En una respuesta a un brote, cuanto más rápido se obtengan datos, antes se podrá actuar”, dice Martha Nelson, epidemióloga genómica del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) en Bethesda, Maryland. Nelson añade que cada semana que pasa, la ventana para controlar el brote se reduce. “Para mí, si no llegamos demasiado tarde, es la pregunta del millón”, agregó. El virus ha tenido meses para evolucionar Los funcionarios federales anunciaron el 25 de marzo que se había detectado una cepa de gripe aviar altamente patógena en vacas lecheras. Desde entonces, el USDA ha confirmado infecciones con la cepa, denominada H5N1, en 34 rebaños lecheros en nueve Estados. A finales de marzo y principios de abril, el USDA publicó un puñado de secuencias virales de vacas muestreadas en Texas y una secuencia de un caso humano. El 21 de abril, el USDA publicó más datos de secuenciación en Sequence Read Archive (SRA). La última carga incluyó unos 10 gigabytes de información de secuenciación de 239 animales, incluidas vacas, pollos y gatos, según dijo Karthik Gangavarapu, biólogo computacional de Scripps Research en La Jolla, quien procesó. El análisis de los genomas sugiere que el brote en ganado probablemente comenzó con una única introducción de aves silvestres en diciembre o principios de enero. “Es una buena noticia que hasta ahora sólo haya habido un salto que podamos discernir. Pero es una mala noticia, en muchos sentidos, que se ha estado propagando probablemente ya desde hace varios meses”, dice Michael Worobey, biólogo evolutivo de la Universidad de Arizona en Tucson, que analizó los genomas. "Este virus claramente se transmite entre las vacas de alguna manera", dice Louise Moncla, viróloga evolutiva de la Universidad de Pensilvania en Filadelfia, que ha estudiado los datos genómicos. Nelson, que está analizando los datos, dice que lo que más le sorprendió fue el alcance de la diversidad genética del virus que infecta al ganado, lo que indica que el virus ha tenido meses para evolucionar. “Entre las mutaciones se encuentran cambios en una sección de proteína viral que los científicos han relacionado con una posible adaptación para propagarse en los mamíferos”, dice. “Los datos también muestran saltos ocasionales de vacas infectadas a pájaros y gatos. "Este es un brote de múltiples huéspedes", agregó Nelson. Un solo salto, hace muchos meses, es “la conclusión más confiable que se puede sacar”, según los datos disponibles, dice Eric Bortz, virólogo de la Universidad de Alaska Anchorage. Pero una advertencia importante es que no está claro qué porcentaje de vacas infectadas representan las muestras, afirma. Ésa es sólo una de las muchas lagunas de datos. Los científicos carecen de información sobre la fecha precisa de recolección de cada muestra y el estado donde fue recolectada. Esas brechas son “muy anormales”, dice Nelson. Los “metadatos” faltantes dificultan la respuesta a muchas preguntas abiertas, por ejemplo cómo se transmite el virus entre las vacas y los rebaños, y dificultan precisar exactamente cuándo el virus pasó a las vacas. Estos conocimientos podrían ayudar a controlar una mayor propagación viral y proteger a los trabajadores de las granjas ganaderas "que menos pueden permitirse el lujo de estar expuestos", dice Worobey. Worobey, Gangavarapu y sus colegas ahora se apresuran a analizar algunos metadatos descubiertos a través de la investigación en línea de Florence Débarre, bióloga evolutiva de la agencia nacional de investigación francesa CNRS en París. Gangavarapu dice que las fechas y la información geográfica de 152 de las 239 muestras se extrajeron de una presentación del USDA publicada en YouTube el 26 de abril. Los investigadores también quieren más muestras de ganado y aves silvestres para obtener más información sobre el origen exacto del brote y descifrar otro enigma. Los datos genómicos revelan que el genoma viral secuenciado de la persona infectada no incluye algunas de las mutaciones características observadas en el ganado. "Eso es un misterio para todos", dice Nelson. Una posibilidad es que la persona haya sido infectada por un linaje viral diferente, que infectó al ganado que no había sido hisopado. Otro escenario menos probable, que no se puede descartar, dice Nelson, es que la persona haya sido infectada directamente por un ave silvestre. "Esto plantea una gran cantidad de preguntas sobre qué caja negra de muestras nos falta", señaló. Shilo Weir, especialista en asuntos públicos del USDA, dice que la agencia decidió publicar los datos de la secuencia no analizada en la SRA para hacerlos públicos lo antes posible. Y agregó que “trabajarán lo más rápido posible” para publicar archivos seleccionados en GISAID con información epidemiológica relevante, y continuará poniendo a disposición datos sin procesar en la SRA de forma continua.
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